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最后登录2024-6-30
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癌症依赖地图团队的RNAi筛选实验证明了与几个蛋白质家族相对应的基因。看下面的旭日树状图,了解更多。
麻省理工学院和哈佛大学研究院以及丹娜- 法伯癌症研究所的研究人员确定了760多个基因,具有这些基因的来自多种类型的癌细胞,具有很强的依赖性生长和生存。这是人类在建立癌症基因脆弱点综合目录的最大努力之一。
研究人员今天在“ Cell ”杂志上报道的这些“依赖”基因中的许多都是针对某些特定癌症类型的。然而,其中约10%在多种癌症中是常见的,这表明针对这些核心依赖的相对较少的基因治疗方法可能有望抵抗多种肿瘤。
癌细胞可能存在各种各样的遗传错误,从小突变到染色体之间的DNA交换。如果错误的关闭关键基因,癌细胞将通过调整其他基因的活性来修复,频繁的出现会导致癌细胞适应这种环境来继续生存。
识别这些依赖关系为科学家提供了更深入了解癌症生物学并确定新的治疗目标的机会。
美国癌症研究所研究所负责人兼资深作者威廉·哈恩(William Hahn)说:“癌症的特征研究还在继续,这些以遗传学和测序为基础。
RNAi诱导的基因 沉默使用称为小片段干扰RNA。为了运行全基因组RNAi,研究人员将细胞暴露于siRNA集群并跟踪细胞的行为。
研究人员David Broad博士解释说:“干扰细胞可以做的最简单的事情是让他们随着时间的推移不断增长,并看到哪些细胞快速增殖。“如果具有某种沉默基因的细胞消失,这意味着这种基因是癌细胞增殖所必需的。
数据揭示了癌细胞依赖性的突出特征。许多依赖性是癌症特异性的,因为它们的沉默只影响细胞系的一部分。然而,超过90%的细胞系对76个基因中的至少一个具有很强的依赖性,这表明许多癌症依赖于相对较少的基因和途径。
使用来自每个细胞系的一组分子特征(例如,突变,基因拷贝数,表达模式),该小组还生成了基于生物标志物的模型,帮助解释769个依赖关系中的426个生物学特征。大多数生物标志物分为四大类:
基因突变或基因表达减少,基因功能上或结构上与另一基因(也称为旁系同源依赖)结合相关的表达增加,令人惊讶的是,超过80%的生物标志物的依赖与基因表达的变化(上升或下降)有关。突变仅占生物标志物相关依赖性的16%。
团队发现的20%的依赖关系与以前被确定为潜在药物靶点的基因相关。
这是一个巨大的机会,因为这意味着我们有许多迄今尚未开发的了解癌症的途径。”研究人员说。
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