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各位大神,基因突变丰度值是什么意思?2.9%?

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发表于 2022-12-6 10:03:12 | 显示全部楼层 |阅读模式 来自: 中国天津
TP53基因突变,丰度值2.9%,怎么理解?

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发表于 2022-12-6 10:58:47 | 显示全部楼层 来自: 中国北京
病理会诊:专家看切片
突变丰度,即 VAF(Variant Allele Fraction),是指在特定的基因位点所有的等位基因中,突变的等位基因所占的比例。TP53突变丰度的高低,没有太大意义,样本中可能肿瘤细胞的比例不高,另外可能不是所有的肿瘤细胞都带有这个突变。
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发表于 2022-12-6 11:19:30 | 显示全部楼层 来自: 中国北京
dxjjejx 发表于 2022-12-6 11:06
老师您好 病理结果显示TP53+ 但基因检测TP53显示没有突变 这个怎么看呢

免疫组化看的是p53蛋白的表达,高表达提示有可能存在TP53基因突变,但是并不意味着一定有突变,应以基因测序为准。
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发表于 2022-12-6 11:06:57 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国
橙色雨丝 发表于 2022-12-06 10:58
突变丰度,即 VAF(Variant Allele Fraction),是指在特定的基因位点所有的等位基因中,突变的等位基因所占的比例。TP53突变丰度的高低,没有太大意义,样本中可能肿瘤细胞的比例不高,另外可能不是所有的肿瘤细胞都带有这个突变。

老师您好 病理结果显示TP53+ 但基因检测TP53显示没有突变 这个怎么看呢
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发表于 2022-12-6 11:28:32 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国
橙色雨丝 发表于 2022-12-06 11:19
免疫组化看的是p53蛋白的表达,高表达提示有可能存在TP53基因突变,但是并不意味着一定有突变,应以基因测序为准。

感谢老师
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 楼主| 发表于 2022-12-6 12:00:06 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国天津
谢谢您的回复!
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 楼主| 发表于 2022-12-12 08:16:03 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国天津
橙色雨丝 发表于 2022-12-06 10:58
突变丰度,即 VAF(Variant Allele Fraction),是指在特定的基因位点所有的等位基因中,突变的等位基因所占的比例。TP53突变丰度的高低,没有太大意义,样本中可能肿瘤细胞的比例不高,另外可能不是所有的肿瘤细胞都带有这个突变。

谢谢您!
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 楼主| 发表于 2022-12-13 16:23:02 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国天津
橙色雨丝 发表于 2022-12-06 10:58
突变丰度,即 VAF(Variant Allele Fraction),是指在特定的基因位点所有的等位基因中,突变的等位基因所占的比例。TP53突变丰度的高低,没有太大意义,样本中可能肿瘤细胞的比例不高,另外可能不是所有的肿瘤细胞都带有这个突变。

雨丝老师,是不是不要纠结突变的丰度,只要是突变了就增加了治疗难度了,是吧?
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发表于 2022-12-14 11:10:56 来自手机 | 显示全部楼层 来自: 中国北京
初来乍到 发表于 2022-12-13 16:23
雨丝老师,是不是不要纠结突变的丰度,只要是突变了就增加了治疗难度了,是吧?

大致是这样。
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